История Ховрина неразрывно связана с его владельцами в Новое время. Есть в этом перечне и Василий Борисович Шереметев, крупный военачальник середины XVII века и сподвижник царя Алексея Михайловича.
За боярином Шереметевым деревня Ховрино с усадьбой числилась еще в 1646 году. Считается, что само село, которое ведет историю с начала XV века, в Смутное время уничтожили. По данным писцовых книг, как свидетельствуют москвоведы, в 1623 году на месте деревни была пустошь. Впрочем, к середине XVII века в Ховрине вновь появились деревянная церковь (освященная во имя Николая Чудотворца) и 9 крестьянских дворов на 33 человека.
К 1678 году имелось уже 11 крестьянских дворов и 4 бобыльских (то есть без земельных наделов), двор вотчинника, а также конюшенный и скотный дворы. Развивалась деревня по большей части без участия ее владельца. Шереметев долгое время провел в плену у крымских татар. А когда боярина освободили, Василий Борисович Шереметев (1622–1682), XVII век он прожил недолго и вскоре умер. В 1682 году Шереметев завещал Ховрино своей дочери, бывшей замужем за князем Яковом Алексеевичем Голицыным.
Василий Борисович Шереметев был человеком незаурядным: в 15 лет он начал служить стольником при царе Михаиле Федоровиче, затем стал его почетным телохранителем (или рындой), сопровождал самодержца в его многочисленных поездках. В 1645 году Василий Борисович отправился воеводой в Мценск, но эта служба продлилась недолго. Спустя несколько месяцев приходят сведения об очередном нападении крымского хана на владения России на юге. Шереметев становится одним из руководителей войска, направленного новым царем Алексеем Михайловичем против татар.
После он несколько лет служил первым воеводой в Тобольске, а в 1654 году уже боярином (этот статус Василий Борисович получил в 1653 году) пришел на помощь войскам гетмана Богдана Хмельницкого на Украине в борьбе против поляков. О себе Шереметев оставил добрую славу: после смерти Хмельницкого казаки просили вернуть боярина, чтобы не допустить междоусобицы. В результате в 1658 году он был назначен в Киев первым воеводой.
Но приходилось Шереметеву непросто. Трижды на русские гарнизоны нападали казаки заключившего союз с поляками гетмана Ивана Выговского. Но безуспешно. Василий Борисович отметился также тем, что добровольно отпустил по домам всех пленных казаков, чем заслужил похвалу царя Алексея Михайловича.
В 1660 году Москва решила начать крупное наступление вглубь Речи Посполитой. Одной из целей стал Львов. Вместе с войсками Шереметева ожидалось подкрепление в виде казаков гетмана Юрия Хмельницкого. Боярин, правда, упустил удачный момент: на помощь Польше подоспели крымские татары. Хмельницкий же все никак не решался присоединиться к русским войскам. В результате Шереметев упустил инициативу и отступил к городу Чуднову (сейчас — в составе Житомирской области Украины). Там поляки вели войну на истощение и добились своего. А Хмельницкий вместо помощи русским войскам перешел на сторону Речи Посполитой.
Тяжелейшее поражение привело к тому, что Шереметев капитулировал на условиях оставления Киева и Чернигова (правда, война с Польшей продолжалась до 1667 года — и там России удалось нивелировать потери). Василия Борисовича взяли в плен. Польша передала его крымским татарам — воевода остался у них на целый 21 год. Шереметев жаловался на нечеловеческие условия содержания. Много раз царь Алексей Михайлович и его сын Федор Алексеевич предпринимали попытки освободить боярина, но они срывались, в том числе когда казалось, что долгожданная свобода обретена. Самодержцы не бросали пленника: регулярно поддерживали Василия Борисовича и его семью.
Из татарского плена Шереметев вышел только в конце 1681 года — истощенный, изможденный и с практически уничтоженным здоровьем. Он занял свое место в Боярской думе и не раз сидел за столом у государя, но прожил лишь полгода после возвращения. В апреле 1682 года военачальника не стало.
