Центральное Чертаново не отличается большим количеством водоёмов — здесь есть лишь несколько прудов. Реки же просто спрятаны. Как раз с местных прудов стоит начинать поиски одного из крупнейших притоков Москвы-реки.
Две реки, не считая их менее значительных по размерам притоков, пересекают Центральное Чертаново с запада на восток, подчёркивая общий уклон местности. Хотя вернее было бы сказать пересекали, ведь сейчас, на современных картах, мы можем найти разве что их фрагменты, местами оформленные в пруды. Жертвами развивающейся городской застройки стали Городня и Котляковка — по большей части в пределах района их течения спрятаны в подземные коллекторы. Главной рекой Центрального Чертанова можно по праву считать Городню.
Красный пруд.Во времена, когда землями вдоль реки владел Борис Годунов, рыбаки из окрестных деревень по всему течению реки выстраивали плотины — городили. По одной из версий так река и получила своё название. Годунов решил эту разрозненную систему привести к единому знаменателю. Для достижения этой цели началось строительство каменной плотины — таким образом, уже в 1600 году на Городне образовался огромный Борисовский пруд.
Она является вторым по размерам правым притоком Москвы-реки в городской черте. Когда-то она вместе с прудами выступала в роли своеобразного водного барьера на южных окраинах столицы, а сейчас местами подчёркивает административные границы между районами Москвы. Большая часть Городни (за пределами Центрального Чертанова) протекает в открытом русле, что отличает её от многих рек, долины которых потеснила городская застройка. Однако и Городня была довольно сильно изменена за свою долгую историю. Но и сейчас протяжённость течения превышает 18 километров, а площадь бассейна составляет примерно 100 квадратных километров. В соседнем Ясеневе Городня максимально сохранила свой естественный вид — там, в пределах Битцевского леса, находятся её истоки. Река образуется при слиянии нескольких ручьёв неподалёку от станции метро «Битцевский парк». Как раз покидая Битцевский лес, Городня проходит по границе Центрального Чертанова, а полноценно на территории района она оказывается на участке между Чертановской улицей и Варшавским шоссе. Сама река тут не показывается, течёт под землёй, зато в её долине сформированы живописные Кировоградские пруды. Каскад прудов вытянут вдоль Кировоградского проезда. Три водоёма получили названия по направлению течения: Верхний, Средний Красный пруд, 2020 год и Нижний. Появились они в 70-е годы прошлого столетия, в то время, когда Городню убирали в коллектор, а название происходит от Кировоградской улицы. Интересно, что изначально водоёмов получилось четыре, но позже ближний из них к Чертановской улице засыпали.