Водную систему Тимирязевского района образует река Жабенка со своими притоками. Не все из них сейчас можно обнаружить на поверхности — многие малые водотоки столицы частично или полностью скрыты в подземных коллекторах. Однако проследить их прежние долины можно и в наши дни, в том числе с помощью прудов.
Местные водоёмы, как правило, образовались в долинах рек, что характерно и для других районов Москвы. Иногда по бывшим водотокам проложены улицы или бульвары, а названия рек сохраняются в топонимике.
Главной рекой Тимирязевского района по праву можно считать Жабенку. Водоёмов в районе немало. Самый крупный из них — Большой Садовый пруд — расположен как раз на этой реке. Сама Жабенка тоже по местным меркам река значительная. Её длина составляет примерно шесть километров, а площадь водосборного бассейна — около семи квадратных километров. Начинается этот правый приток Лихоборки на восточной границе Тимирязевского парка, там река выходит из-под Тимирязевской улицы в районе дома 42.
Верхнее течение Жабенки непостоянное, в виде сухой канавы её русло тянется на запад южнее овощной опытной станции им. В. И. Эдельштейна. На этом довольно прямом участке до окончания Пасечной улицы река принимает ряд безымянных левых притоков, а перед самой Пасечной можно обнаружить остатки плотины, которая раньше перекрывала Жабенку. Плотину построили ещё до революции 1917 года, чтобы контролировать уровень воды в реке; она служила также научным наблюдательным пунктом для определения засушливости летнего периода. Интересно, что Жабенка плотину разрушила — сильные потоки воды в половодье подмыли и снесли постройку. Сейчас от плотины остались только боковые опоры по берегам, а для нас это служит хорошим свидетельством того, что в былые времена течение этой небольшой реки было куда интенсивнее.
Фермские пруды, 2020 год
Ниже бывшей плотины Жабенка поворачивает на север. Почти сразу её течение начинает расширяться и разделяется на два рукава, образуя похожий на рогатку Верхний Садовый пруд. Он окружает небольшой живописный Утиный остров. Пруд выполняет роль отстойника перед впадением Жебенки в Большой Садовый пруд. Главный водоём района соответствует своему названию: площадью около 19 гектаров, он появился на реке ещё в середине XVIII века на территории парка при усадьбе Петровско-Разумовское. Большой Садовый пруд с тех времён сохранил свою форму. Его вытянутый западный залив остался на память от Коптевского ручья, который на этом месте когда-то впадал в Жабенку. На самом деле Коптевский ручей можно найти и сейчас, только вот протекает он под землёй. Начинался ручей в районе Старокоптевского переулка и проходил по нынешнему Коптевскому бульвару. Теперь по части его долины проходит подземный канал-водосброс — по нему в Большой Садовый пруд попадают волжские воды из Химкинского водохранилища через Верхний Головинский пруд. Таким образом, и река Жабенка, и Большой Садовый пруд на ней являются частью Лихоборской обводнительной системы, питающей саму Яузу.
Ниже Большого Садового пруда Жабенка течёт по подземному коллектору. Проходя вдоль Большой Академической улицы, всё так же под землёй, река принимает небольшой правый приток — Фермский ручей. Раньше этот ручей начинался на территории Мичуринского сада, к югу от каскада Фермских прудов, образованных в его долине. Как и Большой Садовый пруд, эти водоёмы также относятся к XVIII веку. Своё название система прудов получила оттого, что на их берегах ещё Пётр I основал ферму по голландскому образцу. Пруды сохранились, а Фермский ручей ниже них продолжает своё течение уже под землёй. Заканчивается путь Жабенки за пределами Тимирязевского района. Её подземное течение, пройдя под Дмитровским шоссе, вливается в Лихоборку, и их объединённые воды продолжают движение в сторону Яузы.
